黎族巫醫為人治病時，有一套自己的方法，先通過黎族診斷法查明病因，以便在用藥時做到有的放矢。接著是採用占卜的形式，通過卦象來判斷是什麼鬼怪作祟而導致了疾病，需要獻祭什麼牲畜才能換回病人的靈魂，以決定用哪種性畜祭獻。黎族巫醫的占卜，一般以米卜、雞卜為主，根據米卜、雞骨的上下正反卦位或卦符所組成的「卦象」，以判斷病的輕重、安危、觸犯何種鬼靈以及需要祭品等。如發熱、頭痛症的米卜：取一碗米，點三枝香，長把尖刀立在米中央，隨之口唸咒語，如尖刀立穩，即查明為「灶爐鬼」作祟，需要殺豬祭祀。一般情況下，凡肚子痛、嘔吐及洩瀉症的，都會認為是「風鬼」作祟，需要殺雞祭祀;急性風症的，是「風火山鬼」作祟，急需殺黃牛祭祀;婦女難產症，為「無頭鬼」作祟，要殺羊、雞祭祀;突然昏倒不省人事症，為「龍水鬼」作祟，要殺白雞一隻、水蛇一條祭祀，還要寫卦符帖在門口和周圍樹木。海南各地黎族的祭鬼方法從形式上看是有些不同，但就其內容看均是大同小異。
巫醫在本氏族、村裡或鄰近村莊發生流行病時，還擔負著主持有關儀式，以預防和阻止流行病的蔓延，確保人和村子的安全。如美孚方言的黎族群眾，為預防天花、霍亂、鼠疫的流行，要請巫醫舉行宗教儀式，集體出資買雞、豬、羊等牲畜，到野外主要交叉路口祭祀，並每家每戶都要用三角楓樹葉、野菠蘿葉掛在門口，以阻疫病於門外。
巫醫施行治病的過程一般為：令患者坐下或靜躺床上，巫醫左手端一碗清水，右手掌一支香燃燒，連連三次誦唸咒語，(不同的病症念不同的咒語)。咒語念完後，巫醫吸碗中的水一口，噴在病人身上，或抹患者痛處，有時給病人喝一口碗中水，或以筆墨寫神符，後燒神符取灰放入盛水的碗中，即給患者喝神符水，或者以墨將符畫在掌心，進行跳唱唸咒。
巫事行完後，巫醫一般都要給病人服用自己配製的藥，或內服，或外敷，或捻痧，或推摩，或整骨，或囑病人家屬給患者何藥何物、禁忌什麼。還要在門口掛著紅、綠、黃三色紙符於大門外，禁止他人進家門，禁4天才結束。
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