黎醫用藥的理論認為，藥的性、味、效是源於土、水、火、氣四行。土為藥物生長之本，水為藥物生長之液，火為藥物生長之熱，氣為藥物生長運行之動力。這裡簡明敘述了藥物生長的自然條件和生態環境的因果互動作用。水與土偏盛，藥物味為甘;火與土偏盛，藥物味為酸;土氣偏盛，藥物味則澀。
一般來說，「肝脾」類疾病可用甘味、酸味藥物治療，而用苦味及辛味藥物治療可加重病情;「心肺」類疾病可用苦味及辛味藥物治療;「腎」病者可用甘味、鹹味或澀味的藥物治療，或食物治療。黎醫用藥大體分為湯劑、藥酒、粉劑、搗爛劑等。總之，重要在於藥物的配伍，適量即取得更佳療效。
黎醫認為，植物草藥的性能，與地理、氣候有密切的關係。在陽光強烈照射地方生長的草藥，它性能是熱性的;而生長在陰涼地區的草藥，其性能是寒涼。黎醫還把藥物的效能分為寒、涼、熱、溫、清、輕、重等，要求藥物性能和疾病病因相對應，如寒性疾病則用熱性藥物治療等等，這是黎醫辯證施治的方法。
在飲食方面也要注意適應病人身體的需要。在冬季提倡多吃鹹、甜、酸的食物，多吃油，多吃熱性的食物和野生動物如鹿、山豬、黃麂、蛇類、羊肉等等，以增加人體對熱量的需要。除冬季外，對於其他季節的飲食則要求不嚴格，甜淡酸鹹凡易消化吸收均可。
此外，黎醫在人的日常行為方面也有些要求，強調人的肉體、言論、情慾和精神都必須有所制約。對身體、精神健康的人平常應選擇適宜的行、坐、臥等，不要隨便佩帶銅錢紅線作護身符。人都應當尊老愛幼，團結鄰居，只有行為高尚的人，才能健康、愉快、長壽。