黎醫的治療方法多種多樣。內治主要服用經熬煮的草藥水為主，外治則有拔火罐、火點、放血療法、艾炙、熱敷、按摩、藥熏蒸療法、藥水浴、外敷法等。在藥物治療的同時，還要調整病者的起居，飲食和精神治療，並且講究飲食禁忌等。
從古至今，仍在臨床實用的黎醫治療方法有：
火針療法：常用布傘鋼線一截，長約10～12厘米，一端磨尖，一端安上木柄，即成火針。使用時，先把尖的部分放在火炭裡烤紅，後蘸上蓖麻油，點火燒熱，待火熄滅後，迅速點刺在治療的部位上，此法常用於治療瘰癘、腰腿痛症等。
針挑療法：用大號縫衣針等針具，根據病症選擇體表上某些部位，運用不同手法挑破其淺層皮膚或皮下纖維而達到治療的效果。先選擇病症的體表或穴位上的病理陽性反應痛點，常規消毒後，用針對準針挑點下針，其手法有淺挑、深挑、慢挑、輕佻、重挑、搖挑等。針挑方式有：點挑、散挑、環挑、排挑，一般一個針挑點反覆數次，挑完後用碘酒消毒創口，此法常用於治療疳積、腰痛、痧症、癇症、癭瘤、痔瘡等病症。
挑痔療法：常用於治療炎性外痔，輕度脫肛等病症。方法是首先在患者腰骶部尋找痔點，形似丘疹(不突起皮膚或稍微突出皮膚或帽針頭大小圓形)，稍帶有光澤，為灰白色、棕褐或淡紅色等，壓不通色，確定位置後，經消毒便用縫衣大號針在定位表皮上縱向挑破0.1～0.2厘米，而後深入皮下挑，將白色纖維物挑斷，一般不出血，挑完後，用2%碘酒消毒，加上膠布貼緊即可，相隔7天後再挑一次即可治癒。
挑疳積治療法：一般用於小兒疳積症、消化不良症。方法是在四縫穴處挑刺並輕輕地擠出黃色粘液，再加雞屎籐適量的粳米混合研成粉，用開水沖後內服則可愈。
燈花炙療法：用燈芯草蘸蓖麻油後，直接點燃在病位或穴位上，以能聽到嘶嘶響的聲音效果為最好，常用來醫治頭痛、四肢麻木、風濕性關節腫痛等症。
艾炙療法：作法是直接在皮膚上炙或淬藥(生薑法、蒜瓣、生鹽)炙，每次15～30分鐘，常用於治療風濕胃痛症、寒性病症，慢性病等。
刮痧法：用銅錢、光銀或藥物等在病人身體上進行刮治的一種治療方法。取煙筒的煙水用碗裝，在刮時用手指沾碗中煙水，塗在病者某些部位，右手握銅錢，從頭頸、背部、四肢向下由近而遠反覆刮，刮的動作要求輕柔有力，以病人有脹、酸、輕度感痛為度，以皮膚出現微紅為宜，它作用是散熱解熱、通裡透表、追風活絡，有調節胃脾功能的療效，常用於痧症、外感及腸胃症等。
藥物薰蒸療法：用燃燒藥物的煙氣或煮藥蒸的氣熏在患處，以達到治病的一種方法 。取軟筋籐、軟筋葉、沈香、人發、檳榔渣等藥物一起燒後，用其產生的煙氣在患處熏，同時用被毯覆蓋患者，此法常用治療外傷性，如骨折、扭傷等。還有一種是用生薑、大楓艾葉、土紫荊、五指樹葉、東風桔葉等，做法同上述，用來治療傷風感冒、週身關節酸痛等，患者以出汗效果最好。
藥物熏洗療法：用大楓艾、舒筋籐、紅蔥、沙姜、老薑、兩面針葉、透骨草等藥物熬煮後，熏蒸在患處，待藥液溫度低到適宜時再行沐浴。此法常用於治療腰腳痛、風濕性關節痛、外傷性肢節扭傷等。
敷貼療法：用幾種草藥搗爛，直接敷在病人痛點或穴位，通過藥物的刺激，調節人體氣血運行，以達到治病的目的。
佩藥療法：選用藥物掛在病人某些部位，達到防病治病目的的一種外治方法。將無傘葉、猴子當葉、飛鼠、兩面針葉、熊毛等藥物混合研成藥粉，後裝入小布袋，佩掛在某些部位，可防病治病，使人健康以及避孕等效果。
內服法：通過審察病因、病症確定治法，然後選用黎醫常用內服藥組方劑、單方、或數種味藥，熬煮內服。其功效有運氣、行血、散結、消滯、祛瘀、活血等，也有清熱解毒、止痛等等。此法可用於醫治各種病痛。
酒療法：採用中草藥單味或數種藥及動物藥來泡酒，後通過喝適量的藥酒以達到防病治病的方法。如蛇酒，取活毒蛇若干條，把線紮緊它的肛門就直接把活毒蛇放入酒罈裡立即密封，待浸泡至酒色變黃即可開壇飲用，還有用動物骨節浸泡酒， 治療風濕病、節肢麻木疼痛等症，常飲此藥酒，可達祛風、追風等功效。
拔罐療法：此法有火罐法、水罐法、油罐法、藥罐法等。工具多用水牛角、黃牛角、羊角、鹿角等，具體做法是將點燃的火放入角洞裡，迅速倒扣在病人的痛點部位、穴位上，到一定時間才取出，即可達到止痛、活血、祛風、除濕、拔毒等作用。此法可治療感冒、哮喘、風濕性腰腿痛、肩周炎等。
藥熨療法：此法有兩種，一為藥熨療法，選用有芳香、止痛祛風、消腫的中草藥如山茶葉、山姜葉、土京、散血丹葉、夜來香等數種搗爛後，擱於火灶裡煨熱，後取出在人體的臍部位反覆來回數次熨即可;二為熱開水療法，用毛巾放入熱開水裡，取出擰乾在病人疼痛部位反覆數次熨即可。此法對治療風濕性關節痛、痺症有一定療效。
食物療法：根據季節與病症的情況，選擇食物、藥物調配製成食品，吃後以達到防病治病的或調補強身的目的。黎醫傳統食療有直接吃水果、蔬菜、禽獸、水產類的藥物，或加工為藥粥、藥湯、菜餚食用，比較注意食物的相剋和禁忌。此法廣泛應用於各科病症及各種虛症的調補作用，還有藥墊療法、藥枕療法、浴足療法等。