水族人濃厚的祖先崇拜觀念，使他們格外注重喪葬儀禮，並在喪葬過程中保留著較為完整的原始信仰習俗。
水族的喪葬過程比較複雜繁紛，其主要程序包括報喪、入殮、擇吉、安葬、立碑、除服用等六個階段，其中不少具有水族的民族特點。家中老人嚥氣辭世後，家人要速派村寨裡的小伙子，四出向亡人的親戚朋友報喪。報喪的目的，既為讓親友有個精神準備，並速備下香燭、魚、糯米、酒、布、錢等弔喪用物。同時，更重要的是使有血緣關係的人共同忌葷舉哀棗除了魚類之外的一切禽畜等肉類。這時，遺屬還要將逝者鋪床用的稻草和穿著過的舊衣服，搬到寨外燒掉。這一名叫「燒老窩」的習俗，說是讓煙火之神將這些用物帶給亡靈使用，實為一種消毒清潔的衛生習慣。即使有些要留用的東西，也得在火堆上用煙火薰燎薰燎。這一來，就算結束了死者的人間煙火生活了，不會將不吉的東西傳給子孫後代了。
與此同時，家人要趕忙燒溫水來洗遺體。據說，只有洗乾淨遺體，沒有臭汗味，才能魂歸祖地，與陰間的福先聚居在一起。洗屍體時，不能讓死者的腳著地，因而要將死者放於竹編的米籮裡，再用溫水自上而下的擦洗。洗屍水要倒在沒有人過往的地方，千萬別讓人踩上此水，否則，認為他的腳會開裂的。
洗淨屍體後，再將遺體另置乾淨的米籮上(如能置於銅鼓上，將更為榮光)，為之穿上壽衣。壽衣要3件、5件等單數棗倘若是年輕媳婦死了，則要等娘家來人驗看。裝殮要讓逝者平躺棺內。切忌頭高腳低，可見其腳部，否則會變鬼作祟云云。裝殮時，還要讓逝者口含銀鈽，手拿紙錢，頭墊紙錢。
此俗說是為了使逝者走入陰間時，才有錢去買水喝、買東西吃。為亡人穿壽衣及放置隨葬物時，應格外小心，所有衣物都不能著地。倘不慎掉落地上，要另換新的，否則亡靈便收不到。此外，裝殮時切忌呼喊活人的姓名，以避免亡靈將所呼喊者的靈魂勾去。
不論是為等待至親驗屍，或停屍待殮，還是裝殮後的祭悼期間，為防止亡靈作祟和黑貓跨過遺體而發生意外，治喪時都要安排人員守靈。守靈時，除喪家外，村鄰皆依俗主動前來幫忙。為了沖淡悲哀氣氛和消除恐懼心理，守靈者或聚而擺古，或跳蘆笙舞、唱花燈戲，或進行頂槓等民間競技活動。
治喪期間，水族還有俗稱「開控」的活動，即設置靈堂，祭掉死者。「開控」的時間可長可短，規模亦看家庭境況而有所不同。「開控」要在靈前點香焚紙，擺設魚、豆腐、酒、飯等祭品。殷富人家還要懸掛3或5、7面銅鼓，再配上鑼、鈸，晝夜敲擊。民間認為，銅鼓聲有上通天神、下達海龍的神力，可令神仙來給亡靈安慰和指路，使逝者上天成仙或入海為龍。「開控」期間還要聘請諳熟水族社會歷史和遷移路線以及死者生平的水書先生，請他們在銅鼓、鑼拔和蘆笙、嗩吶伴奏下，頌揚逝者的一生和為人處事，吟唱水族祖居和遷移路線，祈祝逝者再順江而下，魂歸祖先的老住地。
水族治喪期間，還特別講究忌葷吃素。除了魚等水產品外，在未入葬前所宰殺的家禽家畜皆稱為「南得宇」，喪家及其同一血緣的人都不能沾腥，更不得吃「南得宇」，喪家及其同一血緣的人都不能沾腥，更不得吃「南得宇」。
違者必遭村人譴責。此俗原為吃素祭祖，以示哀痛。後來給抹上了迷信色彩，說是在治喪期間吃了葷，會給家庭招災惹禍，家庭成員中會有人傷殘或早夭。只有等到安葬過後3天，才可開葷。這時，先得殺一隻雞供祭逝者靈位，再用雞血沖水漱口之後，方可開葷。
水族對安葬也十分講究，規矩甚多。壽終正寢者皆為土葬;而非正常死亡者(如產婦因難產而死)，要先火化之後，再行土葬。安葬要請水書先生來選擇吉日。由於葬期有早有晚，因而葬式也有便葬、急葬、深葬、假葬之分。便葬是不舉辦「開控」的悼念活動就安葬。急葬則因條件所限來不及祭悼就埋葬。深葬有兩種形式，一是葬地、葬時都順吉如意，喪家一次挖掘墓穴，讓棺木全部落穴埋葬，此後不再動土的;二是葬地、葬時雖然可以，但尚有一些凶煞，這時得在墓穴上鋪些木板，將棺木墊隔懸空起來，使其不完全落土。
等到吉日良辰時，舉行一番祭悼活動後，再抽掉木板，使棺木落入穴裡，埋土為墳。這種二次葬式，俗稱淺葬。假葬則是一時難以擇到安葬的日子，便將棺木抬往寨外，墊於木頭上，再搭蓋一座臨時草棚為護。於是，或挖一土餅放在棺木上，或用木板圍住棺木，再挑土覆蓋之，藉以象徵已入葬。到了吉日，再行土葬。如今這種假葬已少見了，一般多用淺葬代替之。
出殯前夕，喪家還要請巫師和水書先生來打齋，打齋要宰一頭牛，並聽任牛血流往遍地。水族民間認為，牛血是陰間的水，這一來便可讓逝者在陰間有牛耕田、有水插秧，可得安生。有的地方在撒秧前，還要將神聖的楓葉放在田邊一角，並劃出一小塊田為死者耕種之地。民間認為，這樣便可以得到先人的保護，豐收有望。
水族每個由血緣系統組成的村寨，都有一個公共墓地，水族人的墓室很有特色：用石柱、石板、石條壘砌的長方形墓室，多為二三層，底層埋於土中，放置棺木，中上層露出地面，高1~2.5米，裡面放了各種隨葬物。
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