勤勞勇敢的門巴族，其悠久的歷史，在公元823年立於拉薩大昭寺前的《唐蕃會盟碑)中就有記載：「聖神贊普鶻提悉補野，自天地渾成，入主人間，為大蕃之首領。於雪山高聳之中央，大河奔流之源頭，高國浩地，以天神而後人主，偉烈豐功，建萬世不拔之基業焉。王曾立教法善體，思譯廣被，內政修明，熟嫻謀略，外敵懾服，開疆拓土，權勢增盛，永不衰頹。
此威德無比雍仲之王威嚴煊赫，是故，南若門巴……等雖均可爭勝於疆場，然對聖神贊普之強盛威勢及公正法令，莫不畏服附首，彼此歡快而聽差遣也。」這段節錄的碑文所記載的史實，反映了公元六至七世紀松贊干布及其父輩囊日倫贊普時期「開疆拓土」征服四方的歷史。其中所指的「南若門巴「就是今天門巴族的先民。
關於人類的起源，門巴有自己的「創世紀」神話，至今仍在門巴人中流傳……很早很早以前，世界上沒有太陽沒有月亮，也沒有人。從天上向下望去，一片混沌，什麼也看不到。不知在什麼時候，天神對神猴「江求深巴」說：「你到地上去建立一個人間世界吧。」於是，「江求深巴」就從天上下來了。
起初，「江求深巴」自己獨立生活。
後來，天神又派女神「扎深木」變成猴子模樣要和江求探巴成親。江求探巴嫌扎深木面貌醜陋不予理睬。沒辦法，他倆吵著回到天庭請天神評理。天神對他倆說：「這是上天旨意，你們結婚吧。」聽了天神的話，他倆成親了，繁衍了許許多多的猴子。猴子們不會種地不會打獵，整天上山爬樹採野果扒樹皮吃。
江求深巴和扎深木又上天對天神說：我們的後代都是猴子，怎麼能建立人間世界呢?」天神給了他倆一粒稻穀、一粒蔓加、一粒玉米……讓他倆帶到大地耕種。他倆把種子撒在地上，竟長出了大片的莊稼。於是，大地有了各種糧食。因為沒有火，開始是生吃。江求深巴和扎深木又到天上對天神說：「我們已經會打野獸會種莊稼，但是沒有火，只好生吃。」天神又賜給他倆火種。從此，開始了熟食，猴子越來越聰明，漸漸發出了人語，慢慢地變成了人，人間世界也建立起來了。
神話，本來就是歷史的一部分，對於一個沒有文字的民族來講，更是其歷史的最佳追溯方式。
在墨脫，還有這樣的傳說：九世紀時，紅教始祖、密宗大師蓮花生受藏王赤松德贊之邀來墨脫宏法。他名叫洛本白瑪，由他開創的山叫「白隅欽波白馬崗」，意為「隱密的刻畫的蓮花聖地」。這個聖地裡還包含16個小聖地，故有「聖地之中最殊勝」的說法。
在蓮花生大師開創的這塊奇物聖地裡，有四個「典」，意為「平壩」：關扎典、故給典、拉巴典和巴米典;有三個「林」，意為「轉經之地」：貢地林、白瑪林和松林;有七個「能」，意為「裡面」：得工能、西貢能、金珠能、白瑪西日能、比西能、肉路能和嘎魯能，是一個佛樂勝境，到處是糌粑樹到處是牛奶泉，連扛水都流溢出奶酪。
據說這片聖地，很像多吉柏姆——金剛亥母佛的化身：她的臉向著天躺著;她的頭是南迦巴瓦峰，那是一座終年冰雪覆蓋的雪山;她的脖子是多吉莫之山，這座山在墨脫及拉薩和林芝排龍之間，也是一座雪山;她的心臟在邦辛地區，傳說那裡的人比較聰明，其中心在加佈崗寺;她的肚臍是「德瓦仁欽崩」，意思是聖地的中心也是掌握權力的地方;她的左奶是公堆頗章(宮殿)，那是一座轉經的神山;她的右奶是白瑪西惹河，永不枯竭的河水是她的乳汁;她的左手在波密獨求寺，她的右手在林芝布久，那裡有一個寺廟;她的左腳在察隅，她的右腳在印占區的仰桑河…
總之，東北部的雪峰和向南伸展的一條條山脈，構成了女神的頭、頸、軀幹和四肢，滿山的草木是女神的毛髮，條條溪流是女神的血管。
還傳說，女神的身軀上處處有寶，有取之不盡的糧食、用之不竭的肉類，虎骨、摩香、黃連俯抬皆是……傳說像長了翅膀，很快傳遍了西藏，人們就把這裡稱作是「隱藏著幸福的地方」。
墨脫的神秘，墨脫的聖潔，使多少人帶著美妙的宗教幻想而來，把自己的「忠骨」送至聖地視為極大幸事。墨脫那些「不種青稞有糟杷吃，不養奶牛有酥油喝，不用木材有房屋住」之類的美麗傳說直接導致了十八世紀初期門巴人的遷徙和二十世紀康區藏民的流人。
關於墨脫門巴族的遷徒也有眾多傳說，世代相傳。據說，最早進入白瑪崗(墨脫)的是「門堆朱巴」，即從主隅來的六戶人家。他們是主隅「門堆」村的尖扎、冬德爾、開瑪、降措、朱米、索巴多傑等六戶門巴人，他們歷經艱辛，從德陽山口來到了珞渝的更邦拉山，又沿雅魯藏布江逆流而上，到了邦廓的格波希日，受到當地珞巴人的阻攔。
門巴人將自己珍貴的珠子分送給珞巴人，才順利通過格波希日。他們繼續前行到了吉多村，這裡的珞巴人又不讓通行。他們向珞巴人顯示了自己的武功：冬德爾用長刀砍開一塊巨石，開瑪輕輕用力將一根拐棍全部插入地裡……使珞巴人非常欽佩，於是借給了一塊珞巴人不敢耕種的「鬼地」讓他們耕種。他們砍掉鬼樹，在鬼地上種上了莊稼。從此，「鬼都怕」的門巴人定居了。
六戶門巴人在墨脫的定居，導致了其餘大批門巴人的相繼湧來。以賈班達哥為首的100多戶門巴人，擊退丁主隅的阻攔遷來墨脫後，門隅一帶的門巴人也跟蹤而來。同時，東部的康區藕民也被稱為白瑪崗的墨脫所吸引，千里迢迢來到墨脫尋找「蓮花聖地」。
據(清實錄}記載，在公元'906年，昌都和甘孜地區的藏民，聽說西藏新發現一個叫「白瑪崗」的地方，是一個天生福地，一千多信佛的男女便互相邀約前往墨脫。清政府得悉此事，曾令川滇邊務大臣趙爾豐派人攔阻，招回一部分，餘下的經過長途跋涉，歷盡人間苦痛，路上丟下堆堆白骨後，終於到了墨脫的格當地區。現在墨脫境內的藏族，多數都是康區藏民的後裔，他們已經在這裡繁衍了四至五代人。