維吾爾族有許多禁忌，這些禁忌伴隨著他們信仰的宗教及長期的生活習慣而沿襲下來。在吃的方面，他們不吃未經唸經宰殺的牲畜，不吃自死的牲畜，不吃未放血的牲畜，另外還不吃豬、狗、驢、騾等家畜和禽類。在南疆的部分維吾爾族還禁食馬肉。同時，對任何吃的東西不允許用腳踩，見到囊、餅乾等食物掉在地上，要揀起來放在不易被人踩到的地方;洗碗涮鍋水不能倒在人們走路的地方，而要倒在牆旮旯或不易被人踩到的地方。
在服飾方面，禁止穿袒胸露背和短小的衣服，最反感穿褲衩背心在室外活動和作客。
院落的大門禁朝西開，因為伊斯蘭教的聖地在西邊。但因地形所限，在無可奈何的情況下，也可例外。
在睡覺的時候，禁忌頭朝東腳朝西，或四肢平伸直仰。在屋內對坐的姿式也有要求，一般要求跪坐 ( 炕上或地毯上 ) ，禁忌雙腳伸直，腳底朝人。接受禮物或接茶碗時，要雙手接，單手接被認為是不禮貌的行為。
吃飯時不能隨便撥弄盤中的食物，挑來揀去;不能隨便到鍋灶前面，不要剩食在碗中，如不慎將飯屑或囊渣弄到地上，要揀起來放在近前的餐布上，不要將抓起的飯粒再放在共用的飯盤之中;吃飯或與交談時，禁止吐痰、擤鼻涕、打哈欠、放屁等。吃完飯，長者在領做祝禱時，禁忌東張西望或起立。
抽麻煙 ( 吸毒 ) 、賭錢、偷盜、酗酒、鬥毆、說謊都被視為醜惡行為，受到輿論的譴責。
在麻扎 ( 墓地 ) 和清真寺內，以及澇壩、水源和伙房等地，禁忌大小便、隨地吐痰和攜帶髒的東西。
晚輩不得在長輩面前吸煙、喝酒，口吐粗魯、齷齪的語言。見了長輩要起立、讓坐，並施禮問候。