裕固族分別使用三種語言：東部裕固語、西部裕固語和漢語。
西部裕固語亦稱「堯乎爾語」，屬於阿爾泰語系突厥語族東匈語支。一些學者認為，西部裕固語屬於保存古代突厥語特泰點較多的上古突厥語，並指出它是回鶻文獻語言的「嫡語」。使用這種語言的有亞拉格家、賀郎格家、西八個家三個部落，主要分佈在肅南裕固族自治縣西部，即今天的明花區的蓮花鄉、明海鄉，大河區的韭菜溝鄉和皇城區的馬營鄉等地。
東部裕固族亦稱「恩格爾語」，屬於阿爾泰語東鄉蒙古語族。據研究，它接近於十三世紀的蒙古語，保留較多的古代蒙古語詞彙和語音的特點。使用東部裕固語的有大頭目家、羅兒家、楊哥家、東八個家、四個馬家五個部落，主要分佈在自治縣東部康樂區的康樂鄉、紅石窩鄉、青龍鄉，大河區的紅星鄉，以及皇城區的北峰鄉、北極鄉、東灘鄉等。
使用漢語的主要是居住在明花區前灘和酒泉縣黃泥堡等地的裕固族。操不同語言的裕固族人們，相互人們也以漢語作為共同的交際工具。另外，無論是西部裕固語或是東部裕固語，都吸收了大量的漢語藉詞，涉及的範圍還相當廣泛。另據調查，大河區、皇城區有一部分人兼通兩種裕固語。此外，皇城區有少數人會說藏語。
裕固族先民曾經使用過古代回鶻文，後來，他們失去了自己的文字。現在，他們沒有本民族的文字，通用漢文。
裕固族語言是文化部和國家民委「中國少數民族瀕危語言保護工程」全國試點·搶救保護項目之一，可分為西部語和東部語兩種。裕固族西部語屬阿爾泰語系突厥語族，由古代回鶻語演變而來;東部語屬阿爾泰語系蒙古語族，由東遷至祁連山中部的撒裡畏兀兒人所使用的撒裡畏兀兒語與古蒙古語融合而成。裕固族語言不僅是裕固人相互交流的主要工具，也是裕固族文字失傳後，民族傳統文化傳承、表現的主要方式。
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