菩提祖師是西遊中最神秘的一個大咖，在他身上，有幾個地方一直讓西遊迷們爭論不休——
來源神秘：他住在西牛賀洲，如來卻似乎不知道他的存在，還洋洋得意地對弟子們說西牛無上真。在江湖上，也從未聽說過菩提祖師這號人物。
功夫神秘：他既懂道，又懂佛，還懂儒術，是三教合一的楷模。孫悟空在三星洞學了十年，但前七年都是在掃地，真正學功夫就是三年。可就這三年，就讓他脫胎換骨，成為三界強者。如果再學幾年呢?是不是連如來也控制不住他了?
弟子神秘：菩提祖師教了很多弟子，可奇怪的是，孫悟空在取經路上，卻從未遇到過一名師兄弟，他們好像消失了。他們為何不需露面?
二
除了以上的謎，還有一個最大的謎，即孫悟空不過是在師兄弟面前展現了七十二變小技術，僅僅變了一棵松樹，就被他強行攆出師門，走的時候還威脅他——
「你這去，定生不良。憑你怎麼惹禍行兇，卻不許說是我的徒弟，你說出半個字來，我就知之，把你這猢猻剝皮銼骨，將神魂貶在九幽之處，教你萬劫不得翻身!」
這讓人百思不得其解，提他名字又怎的了?他為何如此害怕別人知道他?
其實，在這段之前，他還針對孫悟空賣弄功夫說了一段話，這段話才是重點——
「這個工夫，可好在人前賣弄?假如你見別人有，不要求他?別人見你有，必然求你。你若畏禍卻要傳他，若不傳他，必然加害，你之性命又不可保。」
大家看，這段深刻的人生哲理，豈是沒有江湖經驗的人說得出的?若是沒有深刻的慘痛教訓，菩提祖師不會對猴子這個行為如此敏感!
三
我們再來看，如來究竟對孫悟空的來歷清楚不。
在原著第七回，孫悟空大鬧天宮，如來應玉帝召喚趕來除妖，一見面就冷笑著對孫悟空說——
「你那廝乃是個猴子成精，焉敢欺心，要奪玉皇上帝尊位?……你那個初世為人的畜生，如何出此大言!不當人子，不當人子!折了你的壽算!趁早皈依，切莫胡說!但恐遭了毒手，性命頃刻而休，可惜了你的本來面目!」
大家看，他對孫悟空的經歷清楚得很，並且警告他不要可惜了本來面目。本來面目是什麼?引人深思。
由此可見，菩提祖師不可能不知道如來的存在，如來也不可能不知道菩提祖師的存在。他們完全有可能在多少年前，有一次深深的交際，甚至有可能經歷了一場戰鬥，雙方都留下了很深的印象。
從此，菩提祖師歸隱山林，閉門授徒，而如來則閉口不提菩提祖師，似乎真不知道他的存在。
其實，在之後的取經路上，孫悟空並沒有遵守祖師要求，不提他的名字，而是多次提到他授徒的事，但江湖中人都裝著沒聽到，真不知是為了什麼!