在封神中石磯娘娘並沒有做什麼傷天害理的事，而且也沒有殺過人，說話恭敬，隱居骷髏山白骨洞修煉，故事還是源於哪吒，據說哪吒年少無知，有一天在城樓上玩，看到了乾坤弓和震天箭，於是就拿起來玩，隨手拉起放了一箭，誰知道這一箭不偏不向的射向了石磯娘娘的弟子碧雲童子，這個概率比中彩票可小多了，碧雲童子隨之倒下身亡，石磯娘娘哪能善罷甘休啊，三不說幾不說打起來了，哪吒哪是石磯娘娘的對手啊，但是石磯娘娘沒有下殺手，帶著找李靖理論去了，沒想到哪吒先下手為強又把石磯另一個彩雲童子打傷了。由此可見石磯娘娘並不是不分青紅皂白。
之後哪吒逃到師父太乙真人那裡去了，石磯娘娘於是就趕到乾元山金光洞太乙真人那裡，問其索要哪吒說個明白，挺客氣的說「道兄!你的門人仗你道術，射死貧道的碧雲童子，打壞了彩雲童兒，還將你乾坤圈、混天綾來傷我。道兄好好把哪吒叫他出來見我，還是好面相看，萬事俱息;若道兄隱護，只恐明珠彈雀，反為不美。」由此可見石磯娘娘根本沒有想殺死哪吒，說個好話認個錯就算了。誰知道這太乙真人是出了名的護犢子，偏不交出哪吒，說打死他，這只是天數。你看看這話說的。
並且還拿元始天尊來說話，簡直是欺人太甚。於是兩人廝打在一起，誰知太乙真人拿出九龍神火罩要滅口，把石磯娘娘罩在神火罩之下，石磯在罩內不知東西南北。太乙真人用兩手一拍，那罩內騰騰焰起，烈烈光生，九條火龍盤繞，此乃三昧真火，石磯哪能受了這個，就這樣被煉回原型了，可憐了她那一身修為。有朋友說原型是什麼?是一塊石頭，據說此石生於天地玄黃之外，經過地水火風，煉成精靈。
話說能稱得上娘娘兩字的尊稱，實力應該可以，據說稱得上娘娘的算上石磯有五位，女媧娘娘，三宵那三位娘娘。怪就怪石磯娘娘沒有背景，沒有法寶，而且也沒有殺心，誰知道太乙真人痛下殺心。背景來說和哪吒比起來，哪吒的背景太強大了，前世是靈珠子，靈珠子原本是女媧娘娘座下的護法童子，後出世換名為哪吒。又是元始天尊特定下凡的特派員，法器眾多。
石磯娘娘是好是壞呢?據說石磯娘娘和李靖的師父度厄真人是好朋友，李靖修煉多年一直不見效果，石磯娘娘於是就勸說度厄真人，先讓李靖下山享受榮華富貴吧，別在山上耽誤了，慢慢修煉。度厄真人就放李靖下山享受榮華富貴去了，這石磯娘娘也是出於好心吧。在加上哪吒殺死身邊童子也沒有說孬話，知道哪吒是無心的，只是要個解釋，認個錯，不但沒有，命還折進去了。